Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER1P34995 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms