Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA7P31268 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms