Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E1P29083 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms