Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PLNP26678 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PLNP26678 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PLNP26678 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PLNP26678 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PLNP26678 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms