Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA2P26232 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms