Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms