Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms