Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDSP20132 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDSP20132 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDSP20132 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDSP20132 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDSP20132 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SDSP20132 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SDSP20132 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDSP20132 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDSP20132 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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