Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PDE6GP18545 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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