Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CREB1P16220 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms