Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD8P13378 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms