Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms