Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMC1P11047 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMC1P11047 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms