Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHGAP10645 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHGAP10645 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms