Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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