Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms