Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF888P0CJ79 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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