Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRPRAP08240 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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