Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCKP06239 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LCKP06239 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCKP06239 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCKP06239 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCKP06239 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCKP06239 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCKP06239 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCKP06239 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms