Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMG1P04279 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms