Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1AO95602 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms