Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PRAMEF10O60809 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF10O60809 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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