Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKNO60260 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKNO60260 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKNO60260 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKNO60260 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms