Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DENRO43583 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DENRO43583 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DENRO43583 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENRO43583 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms