Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms