Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FANCAO15360 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCAO15360 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FANCAO15360 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCAO15360 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCAO15360 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms