Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms