Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8JA6NMD2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8JA6NMD2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms