Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF316A6NFI3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms