Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F8A0AVK6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms