Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNSTRNQ9Y448 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms