Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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