Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
KLF13Q9Y2Y9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF13Q9Y2Y9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms