Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR1DQ9Y2S0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms