Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINLQ9Y2I6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINLQ9Y2I6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms