Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHANK2Q9UPX8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms