Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK1Q9UPV9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms