Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms