Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED23Q9ULK4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED23Q9ULK4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms