Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms