Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTNNA3Q9UI47 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms