Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS7AQ9UBW8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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