Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms