Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGC1AQ9UBK2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms