Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REREQ9P2R6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REREQ9P2R6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms