Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms