Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms