Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6BQ9NRW1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms