Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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