Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms